Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms