Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6aQ78XR0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms