Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stambpl1Q76N33 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stambpl1Q76N33 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stambpl1Q76N33 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stambpl1Q76N33 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stambpl1Q76N33 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stambpl1Q76N33 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stambpl1Q76N33 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms