Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms