Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms