Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms