Protein–RNA interactions for Protein: Q6YI28

2210407C18Rik, EP1, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210407C18RikQ6YI28 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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2210407C18RikQ6YI28 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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2210407C18RikQ6YI28 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
2210407C18RikQ6YI28 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
2210407C18RikQ6YI28 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
2210407C18RikQ6YI28 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
2210407C18RikQ6YI28 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
2210407C18RikQ6YI28 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
2210407C18RikQ6YI28 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
2210407C18RikQ6YI28 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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2210407C18RikQ6YI28 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
2210407C18RikQ6YI28 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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2210407C18RikQ6YI28 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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2210407C18RikQ6YI28 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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2210407C18RikQ6YI28 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
2210407C18RikQ6YI28 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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2210407C18RikQ6YI28 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
2210407C18RikQ6YI28 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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2210407C18RikQ6YI28 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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2210407C18RikQ6YI28 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
2210407C18RikQ6YI28 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
2210407C18RikQ6YI28 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
2210407C18RikQ6YI28 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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2210407C18RikQ6YI28 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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2210407C18RikQ6YI28 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
2210407C18RikQ6YI28 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
2210407C18RikQ6YI28 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
2210407C18RikQ6YI28 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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2210407C18RikQ6YI28 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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2210407C18RikQ6YI28 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
2210407C18RikQ6YI28 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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2210407C18RikQ6YI28 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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