Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms