Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shc4Q6S5L9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms