Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HjurpQ6PG16 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms