Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms