Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms