Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFC5

Lrit2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit2Q6PFC5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit2Q6PFC5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit2Q6PFC5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit2Q6PFC5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit2Q6PFC5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit2Q6PFC5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit2Q6PFC5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit2Q6PFC5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms