Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms