Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms