Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms