Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttbk1Q6PCN3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttbk1Q6PCN3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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