Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms