Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc4Q6PAV2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms