Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms