Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms