Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms