Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms