Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CltbQ6IRU5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CltbQ6IRU5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CltbQ6IRU5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CltbQ6IRU5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CltbQ6IRU5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CltbQ6IRU5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CltbQ6IRU5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CltbQ6IRU5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CltbQ6IRU5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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