Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms