Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca2Q6DIC0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms