Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep290Q6A078 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep290Q6A078 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep290Q6A078 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep290Q6A078 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep290Q6A078 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Cep290Q6A078 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Cep290Q6A078 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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