Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Pdzrn3Q69ZS0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Pdzrn3Q69ZS0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzrn3Q69ZS0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzrn3Q69ZS0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Pdzrn3Q69ZS0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzrn3Q69ZS0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzrn3Q69ZS0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzrn3Q69ZS0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzrn3Q69ZS0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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