Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg9aQ68FE2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Atg9aQ68FE2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Atg9aQ68FE2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Atg9aQ68FE2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Atg9aQ68FE2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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