Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp4fQ66X05 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms