Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprcapQ64697 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprcapQ64697 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprcapQ64697 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprcapQ64697 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms