Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PtprdQ64487 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PtprdQ64487 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PtprdQ64487 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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PtprdQ64487 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PtprdQ64487 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PtprdQ64487 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PtprdQ64487 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PtprdQ64487 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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