Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms