Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc18Q640L5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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