Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms