Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Hoxa13Q62424 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Hoxa13Q62424 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Hoxa13Q62424 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Hoxa13Q62424 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa13Q62424 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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