Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrhQ62361 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrhQ62361 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrhQ62361 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrhQ62361 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TrhQ62361 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrhQ62361 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrhQ62361 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrhQ62361 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrhQ62361 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms