Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Kdm5dQ62240 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Kdm5dQ62240 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
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