Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms