Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd180Q62192 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd180Q62192 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms