Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms