Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms