Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf12Q61286 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms