Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acvr1bQ61271 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms