Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp7Q60973 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms