Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms