Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms