Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms