Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms