Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms